1. Sr. Alfonsa OSF (1964-1967)
2. Sr. Canisia Dekkers OSF (1967-1972)
3. Sr. Theresia OSF (1972-1974)
4. Sr. Suitbertha OSF (1974-1976)
5. Sr. Imeldine Rumengan SJMJ, S. Pd (2019 - sekarang)
Semoga dibawah kepemimpinan Suster Imeldine SMP Santo Yoseph semakin maju dan berkembang
Sr. Imeldine Rumengan SJMJ, S. Pd